A Biblioteca, disponível para consulta no edifício-sede, foi constituída a partir de 1937, e concentra-se principalmente nas seguintes áreas:

:: Direito Constitucional

:: Filologia

:: História do Brasil (especialmente o período da Primeira República)

:: Literatura Brasileira

:: Política cultural

Inclui também obras de e sobre Rui Barbosa. Seu acervo é dinâmico, apresentando, mensalmente, novas aquisições.

O acervo complementa algumas obras da Biblioteca Rui Barbosa, como os Anais da Câmara (até 1959), ou as Leis do Brasil, a partir de 1808. Além do seu acervo corrente, é composta de várias coleções: Folhetos de Cordel, Joanita Blank, Judith Grossman, Joaquim Inojosa, Lucio Cardoso, Murilo Araujo, Manuel Bandeira, Osman Lins, Plínio Doyle, Pedro Nava, Rodrigo de Souza Leão, Rodrigo Melo Franco de Andrade, Ribeiro Couto, Teófilo de Andrade, Thomaz Lopez e Vinícius de Moraes.

A Biblioteca São Clemente está informatizada, e disponível para consulta na base Biblioteca.