A Fundação Casa de Rui Barbosa agrupa suas publicações em coleções temáticas com o intuito de facilitar a divulgação e criar vínculos com o público-alvo.

A mais importante delas é Obras Completas de Rui Barbosa, um projeto editorial de fôlego, já com 137 tomos publicados. A coleção Papéis Avulsos reúne produtos parciais de pesquisas em andamento. Já a mais recente, Coleção FCRB, é subdividida nas séries "Estudos", "Documentos", "Manuscritos" e "Aconteceu na Casa de Rui Barbosa", veinculando a produção dos pesquisadores em atividade.