A linha de pesquisa Estudos machadianos, levando em conta que Machado de Assis e Rui Barbosa foram contemporêneos (Machado era apenas dez anos mais velho que Rui), é desenvolvida no Setor Ruiano, cujo principal objetivo é estudar Rui Barbosa e seu tempo.

Desenvolvida pela pesquisadora Marta de Senna e por vários bolsistas de Iniciação Científica, a linha de pesquisa Estudos machadianos tem como principal produção um portal (www.machadodeassis.net), onde se pode encontrar: uma base de dados sobre citações e alusões na ficção de Machado de Assis; uma revista eletrônica de estudos machadianos (Machado de Assis em linha); e ainda os nove romances do autor, disponibilizados on-line com notas esclarecedoras de referências histórico-literárias e de locais do Rio de Janeiro, do Brasil e do mundo mencionados por Machado de Assis.